慢性腹泻患者一般宜先行直肠或乙状结肠镜检查，必要时做纤维结肠镜或纤维小肠镜检查，对所见肠道粘膜的炎症性或赘生性病变等具有肯定的诊断价值。怀疑胆道和胰腺病变时，做内镜逆行胰胆管造影（ＥＲＣＰ）有重要价值。
Ｘ线钡餐、钡灌肠检查和腹部平片，可显示胃肠道病变，运动功能状态，胆石、胰腺或淋巴结钙化或部分肠梗阻等病变。对消化道有无器质性病变和病变部位，常有明确诊断价值。
Ｂ超、ＣＴ或ＭＲＩ（核磁共振）常可了解肝、胆、胰等内脏病变，对癌和消化系肿瘤引起的腹泻尤有价值。
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