蜂蜜中蛋白质的均含量为0.3%。蛋白质是人体组织，酶，色素，免疫体和其它特异性物质的组成分，另外它在化过程，机体代谢反应和保护反应中起着重要用。蜂蜜中氨酸量种类甚多，已知含有18种氨基酸其中8种为人必需氨基。酸氯基是蛋白质的组成成分，其营养价值与蛋白质相同。